Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NAE1Q13564 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NAE1Q13564 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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