Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROD1Q13562 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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