Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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