Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms