Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTK7Q13308 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTK7Q13308 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms