Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR1H3Q13133 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1H3Q13133 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1H3Q13133 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1H3Q13133 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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