Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK2Q13002 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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