Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PTPN13Q12923 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PTPN13Q12923 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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