Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMA1Q12791 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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KCNMA1Q12791 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMA1Q12791 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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