Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms