Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NCBP1Q09161 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms