Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACSM1Q08AH1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms