Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms