Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EGR3Q06889 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms