Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCDQ05655 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms