Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLOD1Q02809 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLOD1Q02809 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms