Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01132-202ENST00000641214 1085 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LINC02251-201ENST00000554798 1224 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 AC099518.2-201ENST00000565802 704 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNB1Q02641 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms