Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms