Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BNC1Q01954 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNC1Q01954 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms