Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F1Q01094 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms