Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms