Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX6P78412 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX6P78412 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRX6P78412 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRX6P78412 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX6P78412 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX6P78412 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms