Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF3P61204 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARF3P61204 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARF3P61204 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARF3P61204 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARF3P61204 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARF3P61204 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARF3P61204 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARF3P61204 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms