Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVPABLB-1P60509 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms