Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC12A2P55011 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms