Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGDP52209 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGDP52209 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGDP52209 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms