Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRPC1P48995 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms