Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDKN1BP46527 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms