Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GJA4P35212 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA4P35212 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA4P35212 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms