Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTX2P32243 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OTX2P32243 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms