Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD40LGP29965 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms