Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM21P19474 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms