Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB1P14653 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms