Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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