Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD8BP10966 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms