Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms