Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTA1P02549 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms