Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHG1P01857 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms