Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms