Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX4O95219 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX4O95219 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms