Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E2F6O75461 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E2F6O75461 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms