Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms