Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms