Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CREB3O43889 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CREB3O43889 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms