Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EDIL3O43854 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EDIL3O43854 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms