Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CALUO43852 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CALUO43852 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALUO43852 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALUO43852 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms