Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA2O43364 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA2O43364 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms