Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CENPBD1B2RD01 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms