Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJE1A6NN92 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms