Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF346Q9UL40 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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